A pecuária desempenha um papel muito importante na agricultura da PNSACV, quer como actividade principal das explorações agrícolas, quer nos casos em que é complementar.

Relativamente à espécie bovina, a maior concentração de efectivos ocorre nas freguesias do concelho de Odemira, explorados em regime semi-intensivo, com a aptidão para carne em larga maioria. A produção é obtida através de animais com bastante especialização, fruto de cruzamentos industriais das raças autóctones Alentejana e Garvonesa com a raça Limousine. Nos últimos anos, os animais autóctones foram praticamente todos substituídos (por absorção ou por substituição dos efectivos) pela Limousine, sendo raro encontrar animais puros alentejanos ou garvoneses.

Nos restantes concelhos do PNSACV, os bovinos autóctones puros têm vindo também a desaparecer por cruzamento com raças vocacionadas para a produção de carne, como a Charolesa ou a Saler. O número de animais dos efectivos bovinos é variável, conforme a dimensão das explorações, podendo situar-se desde os 3 a 5 animais, até atingir 100 ou mais fêmeas.

A produção de bovinos com aptidão para leite tem ganho uma importância crescente nos últimos dois anos, quer em número de efectivos, quer em número de explorações, localizando-se a sua esmagadora maioria no interior do Perímetro de Rega do Mira e sendo constituídas por animais da raça Frísia.

Quanto aos ovinos, a sua exploração ao longo do PN é feita em regime extensivo, vocacionado para a produção de carne, com algum aproveitamento do leite para fabrico de queijo. Os efectivos são formados, na sua maioria, por animais de raça indefinida, encontrando-se muitos com características resultantes de cruzamentos com a raça Ille de France e verificando-se ainda a existência de alguns animais da raça Merina. A maior concentração de efectivos ovinos ocorre nas freguesias da zona norte do PNSACV e na freguesia de Vila do Bispo, a sul. Neste último caso, os rebanhos são constituídos ainda por um número elevado de animais autóctones, nomeadamente da raça Campaniça e da raça Churra Algarvia.

Em relação à espécie caprina, o número de animais é bastante inferior ao das espécies anteriores, o que se deve principalmente às condições naturais existentes no PNSACV, mais favoráveis para a produção de bovinos e ovinos. Assim, os efectivos caprinos localizam-se essencialmente na zona de sub-serra (freguesia de S. Luís e interior das freguesias de S. Salvador e S. Teotónio), sendo compostos em larga maioria, por animais da raça Charnequeira. Nos concelhos a sul do PNSACV, especialmente no de Vila do Bispo, é possível encontrar numerosos efectivos da raça Algarvia. A aptidão principal é a produção de carne, com algum aproveitamento do leite para o fabrico do queijo.

Refere-se ainda a existência de numerosas explorações de suínos de reduzida dimensão em todo o PNSACV, que desempenham um papel importante no rendimento das famílias. As suiniculturas do tipo industrial são poucas e situam-se maioritariamente na freguesia de Aljezur e da Bordeira, criando alguns problemas de poluição devido a deficientes sistemas de tratamento de efluentes.